Lancement international du portail de données sur l'épigénome humain


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Le mercredi 18 mars 2015

Lancement international du portail de données sur l'épigénome humain

Le portail de données de l'IHEC (en anglais seulement) a été créé en vue d'intégrer et de distribuer des ensembles de données produits par divers membres du Consortium international de l'épigénome humain (en anglais seulement) (IHEC). Créé par l'équipe du Dr Guillaume Bourque à l'Université McGill dans le cadre d'un projet financé par le Consortium canadien de recherche en épigénétique, environnement et santé (CCREES) des IRSC, il est composé d'une base de données et d'une interface graphique accueillant actuellement 5 667 ensembles de données épigénomiques. Il donne un aperçu des expériences sur le séquençage du génome réalisées par les membres de l'IHEC regroupées par fournisseur, par type de tissu et par type d'épreuve biologique. Le portail comporte une grille dynamique qui sert à naviguer dans les ensembles de données et qui présente des liens permettant de visualiser les données dans un navigateur de génome ou de les télécharger. L'ajout d'un outil d'analyse de corrélation qui permettra de détecter les similitudes entre différents tissus et épreuves biologiques est à prévoir dans un avenir rapproché. En facilitant la distribution et l'interprétation de données, le portail de l'IHEC contribue à accélérer l'application de données épigénomiques dans les domaines de la santé et de la maladie. Le portail a bénéficié du soutien de CANARIE, de Génome Québec, de Génome Canada et de Calcul Canada.




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