Externalisation ouverte d’alignements de séquences dans un jeu AAA pour la recherche sur le microbiome

Chercheur principal : Jérôme Waldispühl
Thème : Santé
Concours : Concours Génome Canada - Programme de partenariats pour les applications de la génomique (PPAG)
Statut : En cours
Début : 1er oct. 2019
Fin : 30 sept. 2022
Budget : 2 963 580,00 $



MMOS met au point des solutions d’externalisation ouverte en collaboration avec des entreprises de jeux vidéo pour aider à relever les défis en recherche. L’équipe prévoit utiliser l’externalisation ouverte sur une plateforme de jeu pour offrir une solution permettant de produire de multiples alignements de séquences de haute qualité pour de très vastes ensembles de données aux fins de la recherche sur le microbiome. Les processus d’analyses de données automatisés sont d’une efficacité limitée pour générer des alignements de gènes de haute qualité; de plus, la réalisation d’analyses par les experts en génétique prend énormément de temps, et il n’existe aucun paramètre accepté pour déterminer quel est le meilleur alignement. Pour résoudre ce problème, l’équipe du projet intégrera de petits casse-têtes d’alignement dans un nouveau jeu vidéo populaire et recueillera les solutions issues du jeu. Les millions de solutions générées par les joueurs seront utilisées pour créer des algorithmes sur mesure afin de bâtir un meilleur alignement des données de la séquence initiale. L’aspect novateur de cette approche scientifique citoyenne donnera lieu à une couverture de presse et à une exposition médiatique considérables, ce qui se traduira par une augmentation des ventes de jeux pour MMOS et Gearbox. En outre, la filière d’externalisation ouverte ainsi créée sera utilisée pour accélérer la productivité des initiatives canadiennes liées au microbiome et aidera le public à mieux comprendre les répercussions du microbiome sur la santé.

 

Centre de génomique responsable : Génome Québec 


Cochercheur principal :

Attila Szantner 

Massively Multiplayer Online Science (MMOS)